Domborzat:

Japán 6852 szigetből áll, ebből négyet hívunk fő szigetnek: Hokkaidó, Honsú, Sikoku és Kjúsú. A szigeteket együtesen Japán szigetvilágnak nevezzük.

Az ország 75% erdős, hegyes terület. Ezek a területek alkalmatlanok ipari, mezőgazdasági vagy lakossági használatra, instabil talaja és a földrengés veszélye miatt. Emiatt a lakható területek népsűrűsége hatalmas, így Japán a 30. legsűrűbben lakott ország a világon.

Gyakoriak a földrengések, mivel az ország a pacifikus hegységrendszer szeizmikusan aktív területén fekszik. Több kisebb nagyobb földrengés pusztított az országban, ami nem egyszer gyilkos szökőárhoz is vezetett.

Vízrajz:

Az országban nagyobb folyók nincsenek de a sűrű esőzés miatt tele van kisebbekkel. Fontosabb folyói: Abe, Szumida, Tome.

Éghajlata:

Nagyrész mérsékelt, de délre haladva erősen változik. 6 nagy éghajlati övezetre lehet osztani.

1. Hokkaido: Hosszú hideg telek, hűvös nyarak
2. Japán- tenger: Telenként jelentős a havazás. Nyáron hűvösebb van de a föhn jelenség miatt előfordul, hogy kifejezetten magas a hőmérséklet.
3. Közép-Japán: Kontinentális éghajlat. Az évi és a napi közepes hőingás egyaránt magas. Aránylag kicsi a csapadékmennyiség.
4. Szeto- beltenger: Egész évben kellemes a hőmérséklet, mert elhelyezkedésének köszönhetően a körülötte fekvő hegyek védik a széltől.
5. Csendes óceán: Télen hideg, gyakori hóeséssel, de nyáron meleg a monszunszél miatt.
6. Délnyugati-szigetek: Szubtrópusi éghajlat. Meleg telek és forró nyarak. Gyakori a csapadék. Időszakos tájfunok.

Nemzeti parkok:

Hokkaido: Rishiri-Rebun-Sarobetsu Nemzeti Park, Shiretoko Nemzeti Park, Daisetsuzan Nemzeti Park, Akan Nemzeti Park, Kushiro Shitsugen Nemzeti Park, Shikotsu-Toya Nemzeti Park

Tohoku: Towada-Hachimantai Nemzeti Park, Rikuchu Kaigan Nemzeti Park, Bandai-Asahi Nemzeti Park

Kantō: Nikkō Nemzeti Park, Oze Nemzeti Park, Chichibu Tamakai Nemzeti Park, Joshinetsu Kogen Nemzeti Park, Ogasawara Nemzeti Park, Fuji-Hakone-Izu Nemzeti Park

Chūbu: Chūbu-Sangaku Nemzeti Park, Hakusan Nemzeti Park, Minami Alps Nemzeti Park

Kansai: Ise-Shima Nemzeti Park, Yoshino-Kumano Nemzeti Park

Chūgoku & Shikoku: San-in Coast Nemzeti Park, Daisen-Oki Nemzeti Park, Setonaikai Nemzeti Park, Ashizuri-Uwakai Nemzeti Park

Kyūshū: Saikai Nemzeti Park, Unzen-Amakusa Nemzeti Park, Aso Nemzeti Park, Kirishima-Yaku Nemzeti Park

Okinawa: Iriomote Nemzeti Park